Eesti ühiskonna mitmekülgseks kirjeldamiseks pöörab rahvusarhiiv pidevat tähelepanu ka era- ja mittetulundussektoris tekkivale teabele. Lähtudes varasematest kogumistraditsioonidest tegeleb rahvusarhiiv ka eraõiguslike juriidiliste isikute nõustamise ning nende dokumentide kogumisega.
Mõnele eraõiguslikule asutusele on rahvusarhiiv teinud koostööettepaneku ja sellele positiivselt reageerinud asutused on kantud rahvusarhiivi järelevalvealuste ja kogumisallikate nimekirja tunnusega "3". Nõuandeid ja näpunäiteid mittetulundusühingute arhiivide pidamiseks leiab juhisest Mittetulundusühingute arhiivide korrastamine.