Rahvusarhiivis registreeritud dokumendid asuvad avalikus dokumendiregistris http://atp.ra.ee. Asutuse asjaajamist reguleerib Asjaajamiskord.
Arhiivi töötajad ja struktuuriüksused juhinduvad järgmistest põhimäärustest:
Rahvusarhiivi töös lähtume peamiselt järgmistest seadustest ja määrustest: